Shadow of the Ninja utspelar sig i det antika Japan och är ett sidscrollande pusselplattformsspel med rik grafik och animationer. Spelare kommer att spela rollen som Akane, en lärlingninja, när hon använder icke-dödliga smygförmågor som förklädnad och teleportering för att återta sin fridfulla by från en ond samurajklan.